Temporal association between antibiotic use and resistance in Gram-negative bacteria / Associação temporal entre o uso de antibióticos e resistência em bactérias gram-negativas

The β-lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p<0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.

Os medicamentos combinados de β-lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p < 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.

Temporal association between antibiotic use and resistance in Gram-negative bacteria

Abstract The -lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p 0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.

Resumo Os medicamentos combinados de -lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.

Temporal association between antibiotic use and resistance in Gram-negative bacteria / Associação temporal entre o uso de antibióticos e resistência em bactérias gram-negativas

Abstract The β-lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p<0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.

Resumo Os medicamentos combinados de β-lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p < 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.

Análisis comparativo de la actividad antimicrobiana de secreciones y excreciones larvarias de Calliphora vicina y Sarconesiopsis magellanica (Diptera: Calliphoridae) / A comparative analysis of Calliphora vicina and Sarconesiopsis magellanica (Diptera: Calliphoridae) larval secretions and excretions antimicrobial activity

Introducción. La creciente resistencia bacteriana a los antibióticos representa una amenaza mundial de salud pública. Las excreciones y secreciones larvarias derivadas de moscas necrófagas de la familia Calliphoridae podrían configurar una fuente promisoria para contrarrestar sus efectos. Objetivo. Comparar la actividad antimicrobiana de las excreciones y secreciones larvarias nativas, y de las mayores y menores de 10 kDa de Calliphora vicina y Sarconesiopsis magellanica (Diptera: Calliphoridae). Materiales y métodos. El bioensayo se hizo a partir de la técnica de turbidimetría y en el caso de las excreciones y secreciones menores de 10 kDa se determinó la concentración inhibitoria mínima (CIM). Resultados. Las excreciones y secreciones nativas y las menores de 10 kDa de C. vicina y S. magellanica, evidenciaron una potente actividad antibacteriana contra tres cepas de Staphylococcus aureus y cuatro bacterias Gram negativas, siendo las menores de 10 kDa más efectivas que las nativas en las dos especies de moscas evaluadas. Además, las menores de 10 kDa presentaron la misma efectividad, aunque en las pruebas de CIM se observó que las de S. magellanica fueron más potentes en todas las bacterias evaluadas, excepto contra la cepa de S. aureus ATCC 25923. Las mayores de 10 kDa no inhibieron el crecimiento bacteriano. Conclusión. Los resultados validaron, en general, que estas sustancias son fuente importante para el aislamiento y la caracterización de agentes antimicrobianos.

Introduction: The growing resistance to antibiotics worldwide represents a global threat to public health. The larval excretions and secretions derived from necrophagous flies from the Calliphoridae family could represent a promising source for counteracting their effects. Objective: To compare the antimicrobial activity of Calliphora vicina and Sarconesiopsis magellanica (Diptera: Calliphoridae) native excretions and secretions and those weighing more than 10 kDa and less. Materials and methods: We used the turbidimetry technique for the bioassay; we determined the minimum inhibitory concentration (MIC) for excretions and secretions weighing less than 10 kDa. Results: Calliphora vicina and S. magellanica native excretions and secretions and those weighing less than 10 kDa exhibited potent antibacterial activity against three Staphylococcus aureus strains and four Gram-negative bacteria; those weighing less than 10 kDa were more effective than the native ones in the two species of flies evaluated here. Furthermore, excretions and secretions weighing less than 10 kDa had the same effectiveness, except in the MIC trials where S. magellanica excretions and secretions weighing less than 10 kDa were more potent against all the bacteria evaluated, except for S. aureus ATCC 25923. Excretions and secretions weighing more than 10 kDa did not inhibit bacterial growth. Conclusions: These results potentially validate these substances as an important source for isolating and characterizing antimicrobial agents.

Comparação do mecanismo de heterorresistência em Serratia marcescens por time kill curve frente ao meropeném / Comparison of heteroresistance mechanism in Serratia marcescens by time kill curve against meropenem

Serratia marcescens pertence à Família Enterobacteriaceae, é Gram-negativa e anaeróbica facultativa, sendo bem distribuída na natureza; pode ser isolada como saprófita do solo e da água. Possui um significado clínico relevante, pois acarreta infecções nosocomiais e pulmonares em determinados setores da saúde, como unidades neonatais, maternidades e UTIs, além de sepse, meningite, choque endotóxico e infecções do trato urinário. O intuito desse estudo foi analisar o mecanismo de heterorresistência em linhagens sensíveis de Serratia marcescens diante das concentrações testadas de meropeném. As linhagens SR1 e SR2 apresentaram perfil heterorresistente, ao passo que a SR6 demonstrou ser não heterorresistente, com CIM elevado (32µg/mL). Os isolados de Serratia marcescens são suscetíveis ao meropenem, por testes de sensibilidade padrão, mas contêm subpopulações resistentes ao mesmo.

Serratia marcescens belongs to the Enterobacteriaceae family, it is optional anaerobic gram-negative, being well distributed in nature and it might be isolated as saprophytic from soil and water. It has a meaningful clinical significance, because it causes nosocomial and lung infections in certain healthcare sectors, such as neonatal units, maternity units and UTIs; septicemia, meningitis, endotoxin shock and urinary tract infections. The aim of this study was to analyze the mechanism of heteroresistance in susceptible strains of Serratia marcescens in the presence of the tested concentration of meropenem. The lineages SR1 and SR2 presented heteroresistant profile, while the SR6 showed to be nonheterorresistente, with CIM (32 µg/mL). The Isolates of Serratia marcescens are susceptible to meropenem, by standard sensitivity testing, but there are subpopulations resistant to it.

Prevalência de bastonetes Gram-negativos não fermentadores isolados em amostras de hemoculturas / Prevalence of non-fermenter Gram-negative bacilli isolated in blood culture samples

Objetivos: Avaliar a prevalência de bactérias não fermentadoras em amostras de hemoculturas provenientes das Unidades de Terapia Intensiva (UTI's) adulto e neonatal e da Unidade Coronariana (UC); definir o perfil de suscetibilidade aos antimicrobianos das cepas bacterianas prevalentes. Métodos: Foram coletados dados de todas as hemoculturas positivas das UTIs Adulto, Neonatal e UC de um hospital privado, em Juiz de Fora, Minas Gerais, Brasil, de janeiro de 2017 a janeiro de 2019. Resultados: Foram analisados 3.535 resultados de amostras de hemoculturas onde 2.464 (69,7%) foram negativas e 1.071 (30,3%) positivas para algum microrganismo. Dentre as amostras positivas foram encontrados 77 bastonetes Gram-negativos não fermentadores (6,9%), com a prevalência de Acinetobacter baumannii (51,9%) seguido de Pseudomonas aeruginosa (32,5%). As cepas de A. baumannii foram resistentes aos carbapenêmicos e às quinolonas. Quanto às cepas de P. aeruginosa, as drogas testadas que apresentaram maior resistência foram a ampicilina, ampicilina com tazobactam, as cefalosporinas de segunda e terceira geração, exceto ceftazidima; e a tigeciclina. As drogas que apresentaram boa atividade na inibição do crescimento das cepas analisadas foram tigeciclina para A. baumannii e colistina para ambas as cepas. Conclusão: o presente estudo alerta para a resistência a múltiplas classes de antimicrobianos das cepas advindas das UTIs e UC, demonstrando um cenário preocupante e a necessidade de desenvolvimento de novas drogas e novas medidas de controle.

Objectives: To evaluate the prevalence of non-fermenting bacteria in blood culture samples from the adult and neonatal intensive care units (ICUs) and the Coronary Care Unit (UC); define the antimicrobial susceptibility profile of prevalent bacterial strains. Methods: Data were collected on all positive blood cultures from the Adult, Neonatal and UC ICUs of a private hospital in Juiz de Fora, Minas Gerais, Brazil, from January 2017 to January 2019. Results: 3535 results of blood culture samples were analyzed, where 2464 (69.7%) were negative and 1071 (30.3%) positive for some microorganism. Among the positive samples, 77 non-fermenting Gram negative rods (6.9%) were found, with the prevalence of Acinetobacter baumannii (51.9%) followed by Pseudomonas aeruginosa (32.5%). A. baumannii strains were resistant to carbapenems and quinolones. As for strains of P. aeruginosa, the drugs tested that showed greater resistance were ampicillin, ampicillin with tazobactam, second and third generation of cephalosporins, except ceftazidime; and tigecycline. The drugs that showed good activity in inhibiting the growth of the strains analyzed were tigecycline for A. baumannii and colistin for both strains. Conclusion: the present study warns of resistance to multiple classes of antimicrobial strains from the ICUs and UC, demonstrating a worrying scenario and the need to develop new drugs and new control measures.

Desenvolvimento e validação de um aplicativo móvel para identificação de bactérias Gram-positivas e Gram-negativas / Development and validation of a mobile application to identify Gram-positive and Gram-negative bacteria

Objetivo: A internet e os smartphones estão fortemente presentes no cotidiano mundial. Além de proporcionarem comunicação e lazer, os smartphones, por meio de aplicativos, são portas de entrada para as tecnologias da informação e comunicação, recursos utilizados por docentes e discentes como metodologia científica de ensino-aprendizado. Além disso, atuam como ferramenta de apoio para profissionais. As evoluções científicas também abrangem a microbiologia clínica, onde é possível observar a inclusão de recursos tecnológicos com o objetivo de minimizar o tempo de análise e assegurar a qualidade dos resultados; entretanto, a automatização ainda é uma realidade distante em muitos laboratórios do Brasil, portanto, o objetivo desta pesquisa foi desenvolver e validar a funcionalidade de um aplicativo como ferramenta de apoio para discentes e profissionais de microbiologia clínica. Métodos: Pesquisa metodológica, aplicada e de produção tecnológica, realizada de abril a outubro de 2019. Foi escolhida a metodologia de Galvis-Panqueva, que compõe as etapas de construção e validação. Ao final das etapas que compõem a validação, 16 discentes da Ulbra Canoas e oito profissionais de microbiologia clínica avaliaram o aplicativo quanto às percepções como usuários. Após esta avaliação, obteve-se o Índice de Validade de Conteúdo. Resultados: O Índice de Validade de Conteúdo entre os profissionais foi de 0,97 e entre os discentes foi de 0,94, valores aceitáveis para validação. Conclusão: Os resultados atingiram o objetivo proposto e corrobora com demais pesquisas da mesma linha metodológica. O aplicativo atendeu aos critérios de desenvolvimento e validação e mostrou-se uma boa ferramenta de apoio para discentes e profissionais de microbiologia clínica.

Objective: The internet and smartphones are strongly present in the daily world. In addition to providing communication and leisure, smartphones, through applications, are the gateway to Information and Communication Technologies, a resource used by teachers and students as a scientific teaching-learning methodology. In addition, they act as a support tool for professionals. Scientific developments also include clinical microbiology, where it is possible to observe the inclusion of technological resources in order to minimize the analysis time and ensure the quality of the results. However, automation is still a distant reality in many laboratories in Brazil, therefore, the objective of this research was to develop and validate the functionality of an application as a support tool for students and professionals in clinical microbiology. Methods: Methodological, applied and technological production research, carried out from April to October 2019. The GalvisPanqueva methodology was chosen, which comprises the stages of construction and validation. At the end of the steps that make up the validation, 16 students from the Ulbra Canoas and eight professionals of clinical microbiology evaluated the application regarding their perceptions as users. Afterwards, the Content Validity Index was obtained. Results: The Content Validity Index among professiona was 0,97 and among students it was 0,94, acceptable values for validation. Conclusion: The results achieved the proposed objective and corroborates with other researches of the same methodological line. The application met the development and validation criteria and proved to be a good support tool for students and professionals in clinical microbiology.

Caracterización y asociación clínico bacteriológica en la espondilodiscitis piógena / Bacteriological-clinical association and characterization in Pyogenic Spondylodiscitis

Resumen: Objetivo: Determinar la asociación entre las características clínicas y estudios de laboratorio con el tipo de microorganismo aislado en hemocultivos de pacientes con espondilodiscitis piógena. Material y métodos: Es un estudio transversal analítico, se revisaron expedientes clínicos de pacientes con espondilodiscitis piógena desde Enero de 2013 hasta Enero de 2017. Se realizó análisis descriptivo univariado usando frecuencias y porcentajes para variables cualitativas, medidas de tendencia central y dispersión para las cuantitativas. Análisis bivariado mediante prueba de χ2 o test exacto de Fisher. Análisis de variables cuantitativas mediante t Student o U de Mann-Whitney. Se usó coeficiente de correlación de Spearman. Considerando significancia estadística p < 0.05. Resultados: Se obtuvo una muestra de 34 pacientes, 20 (58%) fueron mujeres, mediana (Me) de edad 60 años (52-66). Se aisló en hemocultivos, bacterias Gram positivas 11 (32.4%) y Gram negativas 23 (67.6%). El microorganismo aislado más frecuente fue Escherichia coli 12 (35.3%). Los pacientes con espondilodiscitis por Gram negativas presentaron dolor leve y velocidad de sedimentación globular (VSG) Me 26 mm/hra P (18-36), los pacientes con espondilodiscitis por Gram positivas presentaron dolor severo y VSG Me 38 mm/h P (34-40) (p = 0.000 y 0.028, respectivamente). La VSG y dolor en el grupo de pacientes con espondilodiscitis por bacterias Gram negativas tuvo un coeficiente de correlación de Spearman moderado 0.418, (p = 0.047); en el grupo de Gram positivas, un coeficiente de correlación de Spearman bajo 0.228, (p = 0.507). Conclusión: Existe una asociación clínica y estadística de manera significativa entre los tipos de microorganismo aislado en hemocultivo, la intensidad del dolor valorado en escala visual análoga (EVA) y los niveles de VSG.

Abstract: Objective: Determine the association between clinical characteristics and laboratory studies with the type of isolated microorganism in blood cultures of patients with Pyogenic Spondylodiscitis. Material and methods: It is a cross-analytical study, clinical records of patients with Pyogenic Spondylodiscitis were reviewed from January 2013 to January 2017. Univariate descriptive analysis was performed using frequencies and percentages for qualitative variables, central trend measures and dispersion for quantitative ones. Bivariate analysis by testing of χ2 or Fisher's exact test. Analysis of quantitative variables using T Student or Mann-Whitney U. Spearman's correlation coefficient was used. Considering statistical significance p < 0.05. Results: A sample of 34 patients was obtained, 20 (58%) were women, median (Me) of age 60 years (52-66). Was isolated into blood cultures, Gram-positive bacteria 11 (32.4%) gram negatives 23 (67.6%). The microorganism most common isolate was Escherichia coli 12 (35.3%). Patients with Gram-negative spondylodiscitis had mild pain and globular sedimentation rate (VSG) Me 26 mm/hra P (18-36), patients with Gram-positive spondylodyscitis had severe pain and VSG Me 38 mm/h P (34-40) (p= 0.000 and 0.028, respectively). VSG and pain in the group of patients with gram-negative bacteria spondylodiscitis had a moderate Spearman correlation coefficient of 0.418, (p = 0.047); in the Gram positives group, a low correlation coefficient of Spearman 0.228, (p = 0.507). Conclusion: There is a clinical and statistical association significant between types of isolated microorganism in blood culture, pain intensity valued on analog visual scale (EVA) and VSG levels.

Distribución y caracterización molecular de betalactamasas en bacterias Gram negativas en Colombia, 2001-2016 / Distribution and molecular characterization of beta-lactamases in Gram-negative bacteria in Colombia, 2001-2016

Resumen Las betalactamasas, enzimas con capacidad hidrolítica frente a los antibióticos betalactámicos, son responsables del principal mecanismo de resistencia en bacterias Gram negativas; las de mayor impacto clínico y epidemiológico en los hospitales, son las betalactamasas de espectro extendido (BLEE), las de tipo AmpC y las carbapenemasas. El incremento en su frecuencia y su diseminación a nivel mundial ha limitado cada vez más las opciones terapéuticas tanto en infecciones adquiridas en los hospitales como las que se generan en la comunidad. En Colombia, las redes de vigilancia y los grupos de investigación iniciaron su estudio desde finales de los años 90 y, así, se logró la caracterización molecular de las diferentes variantes; además, se reportó una gran prevalencia y diseminación en los hospitales de mediana y alta complejidad, y se describió el impacto clínico de las infecciones que causan. Dichos estudios han evidenciado el alto grado de endemia de algunas de estas betalactamasas y, en consecuencia, la necesidad de una inmediata implementación de programas para inducir el uso prudente de los antibióticos y de medidas de vigilancia, que permitan controlar y prevenir su diseminación, con el fin de disminuir la morbimortalidad en los pacientes y preservar las opciones terapéuticas disponibles en la actualidad. En esta revisión, se recopiló la información sobre las variantes, la distribución geográfica y la caracterización molecular de las betalactamasas en Colombia, así como los estudios llevados a cabo desde finales de la década de 90 hasta el 2016, lo cual permitió tener un panorama de las betalactamasas que circulan en diferentes regiones, su incremento en el tiempo y sus implicaciones clínicas.

Abstract Beta-lactamases are enzymes with hydrolytic activity over beta-lactam antibiotics and they are the main resistance mechanism in Gram-negative bacteria. Extended-spectrum beta-lactamases (ESBL), AmpC, and carbapenemases have the greatest clinical and epidemiological impact in hospital settings. The increasing frequency and worldwide spread of these enzymes have limited the therapeutic options in hospital-acquired infections and those originating in the community. In Colombia, surveillance networks and research groups began studying them in the late 90s. Different variants of these enzymes have been molecularly characterized and their high prevalence and dissemination in medium and high complexity hospitals, along with a high clinical impact, have been reported. Furthermore, many studies in Colombia have evidenced high endemicity for some of these beta-lactamases, which requires an urgent implementation of antimicrobial stewardship programs in order to preserve the few therapeutic options and infection control strategies to prevent and limit their dissemination. In this publication, we carried out a review of the different enzyme variants, geographic distribution, and molecular characterization of these beta-lactamases in Colombia. Additionally, we describe the available information in the literature regarding studies conducted between the late 1990s and 2016, which provide an overview of the beta-lactamases circulating in different regions of Colombia, their increase over time, and their clinical implications.

Infecciones por bacilos Gram-negativos multirresistentes en neonatología / Multidrug resistant Gram-negative infections in neonatology

Introducción. Las infecciones por bacilos Gram-negativos multirresistentes (BGN-MR) constituyen un problema creciente en las unidades de cuidado intensivo neonatal. El objetivo del estudio fue conocer las características epidemiológicas, clínicas, microbiológicas, evolutivas y los factores de riesgo de infección por BGN-MR resistentes a carbapenemes en el Servicio de Neonatología de un hospital de alta complejidad. Población y método. Se realizó un estudio de cohorte retrospectivo en dicho Servicio, donde se incluyeron los pacientes con infección documentada por BGN-MR del 24/4/2013 al 29/4/2015. Resultados. Se incluyeron 21 pacientes. La mediana de edad gestacional y peso de nacimiento fue 35 semanas y 2070 gramos, respectivamente. Dieciocho pacientes (86 %) tuvieron hemocultivos positivos y el aislamiento microbiológico más frecuente fue Acinetobacter baumannii (17 pacientes, 81 %), seguido por Klebsiella pneumoniae productora de carbapenemasa (3 pacientes, 14 %) y Enterobacter cloacae (1 paciente, 5 %). La mediana de edad al momento del diagnóstico fue de 28 días y todos tenían factores de riesgo para la infección, como cirugía, asistencia respiratoria mecánica, nutrición parenteral, catéter central y antibióticos. El tratamiento antibiótico definitivo fue colistina en todos los casos, combinado en el 84 %. Cinco pacientes (24 %) fallecieron por la infección. La prematurez y el peso < 2000 g fueron factores de riesgo estadísticamente significativos asociados a la mortalidad (p = 0,03 y 0,01, respectivamente). Conclusión. Las infecciones por BGN-MR se presentaron en pacientes con factores predisponentes. Acinetobacter baumannii fue el primer agente etiológico. La mortalidad fue elevada y relacionada con prematurez y bajo peso al nacer.

Introduction. Multidrug resistant Gramnegative (MDRGN) infections are an increasing problem in neonatal intensive care units. The objective of this study was to establish the epidemiological, clinical, microbiological, and evolutionary characteristics of carbapenem-resistant MDRGN infections and the risk factors for them at the Division of Neonatology of a tertiary care hospital. Population and method. A retrospective cohort study was done in this Division in patients with a documented MDRGN infection between 4/24/2013 and 4/29/2015. Results. Twenty-one patients were included. Their median gestational age and birth weight were 35 weeks and 2070 g, respectively. Eighteen patients (86 %) had a positive blood culture; the most commonly isolated microorganism was Acinetobacter baumannii (17 patients, 81 %), followed by carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae (3 patients, 14 %) and Enterobacter cloacae (1 patient, 5 %). The median age at diagnosis was 28 days and all patients had risk factors for infection, including surgery, assisted mechanical ventilation, parenteral nutrition, central venous line, and antibiotics. The definite antibiotic therapy included colistin in all cases; in combination, in 84 %. Five patients (24 %) died due to the infection. Prematurity and a birth weight < 2000 g were statistically significant risk factors associated with mortality (p = 0.03 and 0.01, respectively). Conclusion. MDRGN infections were observed in patients with predisposing factors. Acinetobacter baumannii was the main etiologic agent. Mortality was high and related to prematurity and a low birth weight.

Economic burden of inpatients infected with Klebsiella pneumoniae carbapenemase / Impacto econômico do tratamento de pacientes infectados com Klebsiella pneumoniae carbapenemase

ABSTRACT Objective: To estimate the direct medical costs of drug therapy of Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) infection patients in hospital-based context. Methods: A cost-of-illness study conducted with a prospective cohort design with hospitalized adults infected by KPC. Data collection was performed using an instrument composed of sociodemographic data, clinical and prescription medication. Estimates of the direct costs associated to each treatment were derived from the payer's perspective, in the case of federal public hospitals from Brazil, and included only drug costs. These costs were based on the average price available at the Brazilian Price Database Health. No discount rate was used for the cost of drugs. The costs are calculate in American Dollar (US$). Results: A total of 120 inpatients participated of this study. The total drug cost of these inpatients was US$ 367,680.85. The systemic antimicrobial group was responsible for 59.5% of total costs. The direct drug cost per patients infected by KPC was conservatively estimated at nearly US$ 4,100.00, and about of 60% of costs occurred during the period of infection. Conclusion: The findings of our study indicate a thoughtful economic hazard posed by KPC that all healthcare sectors have to face. The increasing worldwide incidence of these bacteria represents a growing burden that most health systems are unable to deal with. There is an imperative need to develop protocols and new antimicrobials to treatment of KPC, aiming to rearrange resources to increase the effectiveness of healthcare services.

RESUMO Objetivo: Estimar os custos médicos diretos da terapia medicamentosa de pacientes com infecção por carbapenemase por Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC) em contexto hospitalar. Métodos: Estudo de custo de doença realizado com desenho de coorte prospectiva, com adultos hospitalizados infectados por KPC. A coleta de dados foi realizada usando instrumento composto por dados sociodemográficos, medicamentos clínicos e prescritos. As estimativas dos custos diretos associados a cada tratamento foram derivadas da perspectiva dos pagadores, no caso dos hospitais públicos federais do Brasil, e incluíram apenas custos de medicamentos, os quais basearam-se no preço médio disponível na Price Database Health do Brasil. Nenhuma taxa de desconto foi utilizada para o custo dos medicamentos. Os custos foram calculados em dólares norte-americanos (US$). Resultados: Um total de 120 pacientes hospitalizados participou do estudo. O custo total da droga desses pacientes internados foi de US$ 367,680.85. O grupo antimicrobianos de uso sistêmico foi responsável por 59,5% dos custos totais. O custo direto estimado de forma conservadora, por paciente, foi de aproximadamente US$ 4,100.00, e cerca de 60% destes se deram durante o período de infecção. Conclusão: Os achados deste estudo apontam um risco econômico importante relacionado a KPC, o qual todos os setores de saúde terão que enfrentar. A incidência mundial em elevação destas bactérias representa carga crescente, e a maioria dos sistemas de saúde é incapaz de resolvê-la. Há necessidade imperativa de se desenvolverem protocolos e novos antimicrobianos para o tratamento de KPC, com o objetivo de reorganizar os recursos para aumentar a efetividade dos serviços de saúde.

Perfil e prevalência de resistência aos antimicrobianos de bactérias Gram-negativas isoladas de pacientes de uma unidade de terapia intensiva / Profile and prevalence of antimicrobial resistance of negative-Gram bacteria isolated from intensive care patients

Objetivo: Verificar a prevalência de infecção bacteriana e analisar o perfil de resistência aos antimicrobianos dos principais BGN isolados em pacientes internados na UTI. Métodos: Foi realizado um estudo descritivo e retrospectivo de 222 prontuários de pacientes internados na Unidade de Terapia Intensiva do Hospital Santa Casa de Misericórdia de Goiânia, obtendo-se dados de 245 amostras biológicas, no período de janeiro a dezembro de 2016. Resultados: A maioria dos pacientes era do sexo feminino, e foram isolados microrganismos principalmente de urocultura (48,6%). Das 13 espécies de BGN isoladas, Klebsiella pneumoniae foi o microrganismo mais prevalente (35,5%), seguido de Escherichia coli (24,1%), Acinetobacter baumannii (14,3%) e Pseudomonas aeruginosa (11,0%). Em relação às classes de antimicrobianos, houve resistência significativa para quinolonas (88,0%). Considerando o perfil de resistência dos principais BGN isolados, K. pneumoniae apresentou maior resistência para ampicilina e cefalosporinas; em E. coli, a resistência foi maior para ampicilina e ciprofloxacino; já para A. baumannii, cefalosporinas, quinolonas e carbapenêmicos obtiveram os maiores índices de resistência; em P. aeruginosa, a maior resistência foi observada para cefalosporinas e carbapenêmicos. Além disso, foram encontrados três BGN pan-resistentes, sendo eles K. pneumoniae, E. coli e A. baumannii. Conclusão: Observou-se maior prevalência de K. pneumoniae, a resistência foi mais elevada para as quinolonas e a maioria dos BGN apresentou uma importante e elevada multirresistência aos antimicrobianos.

Prevalencia de injuria renal aguda en pacientes tratados con colistina

RESUMEN Introducción: la colistina es un antibiótico eficaz para tratar infecciones causadas por bacterias Gram negativas multirresistentes pero tiende a producir injuria renal aguda. Objetivos: determinar la frecuencia de injuria renal aguda en pacientes adultos tratados con colistina e identificar la presencia de afecciones comórbidas asociadas. Metodología: estudio observacional retrospectivo de pacientes tratados con colistina en el Hospital Nacional, Paraguay, en 2016-2017. Resultados: se estudiaron 80 pacientes, siendo 64% del sexo masculino. La edad media fue 50±17 años. La prevalencia de injuria renal aguda fue 70%. Según los criterios RIFLE hubo lesión en 45% de los casos, riesgo de lesión en 25% y no riesgo/no lesión en 30%. Las afecciones comórbidas más frecuentes fueron la hipertensión arterial (61%) y diabetes mellitus (31%). El germen aislado con mayor frecuencia fue Acinetobacter baumannii (57%), Pseudomonas aeruginosa (24%) y Klebsiella pneumoniae (19%). Los antibióticos más utilizados en forma combinada con la colistina fueron la vancomicina (46%) y los carbapenémicos (43%). Conclusiones: la prevalencia de injuria renal aguda fue 70%. Según los criterios RIFLE predominó la lesión. Las afecciones comórbidas más frecuentes fueron la hipertensión arterial y la diabetes mellitus.

ABSTRACT Introduction: Colistin is an effective antibiotic to treat infections caused by multiresistant Gram-negative bacteria but tends to produce acute renal injury. Objectives: To determine the frequency of acute renal injury in adult patients treated with colistin and to identify the presence of associated comorbid conditions. Methodology: Retrospective observational study of patients treated with colistin in the National Hospital, Paraguay in 2016-2017. Results: Eighty patients were studied and 64% of them were male. The mean age was 50±17 years. The prevalence of acute renal injury was 70%. According to the RIFLE criteria there was an injury in 45% of the cases, risk of injury in 25% and no risk/no injury in 30%. The most common comorbid conditions were hypertension (61%) and diabetes mellitus (31%). The most frequently isolated germs were Acinetobacter baumannii (57%), Pseudomonas aeruginosa (24%) and Klebsiella pneumoniae (19%). The most commonly used antibiotics in combination with colistin were vancomycin (46%) and carbapenems (43%). Conclusions: The prevalence of acute renal injury was 70%. According to the RIFLE criteria, the injury predominated. The most common comorbid conditions were hypertension and diabetes mellitus.

Análise da eficácia da higiene oral de pacientes internados em unidade de terapia intensiva em um hospital de alta complexidade do sul do Brasil / Analysis of the effectiveness of oral hygiene of interned patients in intensive therapy unit in a high-complexity hospital in the south of Brazil

As infecções orais, na Unidade de Terapia Intensiva (UTI), deveriam ser preocupações constantes dos profissionais da área da Saúde ali inseridos, devido às consequências que podem causar na saúde geral dos pacientes debilitados sistemicamente. A criação de um protocolo-padrão de higiene oral é de suma importância para impedir ou tratar tais infecções, o que possibilita ao paciente conforto e qualidade de vida, devendo ser realizada por profissionais qualificados. Métodos: Foi realizado um estudo transversal e descritivo, cuja análise foi descritiva e se desenvolveu na Unidade de Terapia Intensiva de um hospital de alta complexidade no Sul do Brasil, no período de fevereiro de 2016 a fevereiro de 2017. A amostra total foi composta por 35 pacientes, com idade mínima de 18 anos, que estavam internados na UTI do referido hospital, portadores de prontuários e Termo de Consentimento livre e Esclarecido. Resultados: Dentre os microrganismos achados nos exames laboratoriais dos pacientes, apresentaram-se em maior quantidade Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus coagulase negativo e Escherichia coli. Apenas dois pacientes adquiriram o Acinetobacter baumannii. A maioria dos pacientes obtiveram bactérias Gram-negativas presentes em sua microbiota oral. Conclusões: As bactérias patogênicas presentes no meio oral devem ser tratadas e erradicadas. Isso pode ser alcançado por meio de um protocolo-padrão de higiene oral. A participação da Odontologia na equipe multidisciplinar no ambiente hospitalar é de fundamental importância para a indicação da terapêutica adequada.

Oral infections in the Intensive Care Unit (ICU) should be a constant concern of the health professionals inserted there, due to the consequences that can cause in the general health of systemically debilitated patients. The creation of a standard protocol of oral hygiene is of paramount importance to prevent or treat such infections, allowing the patient comfort and quality of life and should be performed by qualified professionals. Methods: A cross-sectional and descriptive study was carried out, which was descriptive and developed in the Intensive Care Unit of a highly complex hospital in the South of Brazil, from February 2016 to February 2017. The total sample was composed by 35 patients with a minimum age of 18 years who were hospitalized in the ICU of the referred hospital, patients with medical records and a Consent Form, free and clear. Results: Among the microorganisms found in the laboratory exams of the patients, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus coagulase negative and Escherichia coli were present. Only two patients acquired Acinetobacter baumannii. Most of the patients obtained Gram-negative bacteria present in their oral microbiota. Conclusions: The pathogenic bacteria that are present in the oral environment must be treated and eradicated. This can be achieved through a standard oral hygiene protocol. The participation of Dentistry in the multidisciplinary team in the hospital environment is of fundamental importance for the indication of the appropriate therapy

Klebsiella variicola and Klebsiella quasipneumoniae with capacity to adapt to clinical and plant settings / Klebsiella variicola y Klebsiella quasipneumoniae con capacidad para adaptarse al ambiente clínico y a las plantas

Abstract: Objective: To compare the genetic determinants involved in plant colonization or virulence in the reported genomes of K. variicola, K. quasipneumoniae and K. pneumoniae. Materials and methods: In silico comparisons and Jaccard analysis of genomic data were used. Fimbrial genes were detected by PCR. Biological assays were performed with plant and clinical isolates. Results: Plant colonization genes such as cellulases, catalases and hemagglutinins were mainly present in K. variicola genomes. Chromosomal β-lactamases were characteristic of this species and had been previously misclassified. K. variicola and K. pneumoniae isolates produced plant hormones. Conclusions: A mosaic distribution of different virulence- and plant-associated genes was found in K. variicola and in K. quasipneumoniae genomes. Some plant colonizing genes were found mainly in K. variicola genomes. The term plantanosis is proposed for plant-borne human infections.

Resumen: Objetivo: Comparar genes de colonización de plantas o de virulencia en los genomas reportados de K. variicola, K. quasipneumoniae y K. pneumoniae. Material y métodos: Se utilizaron análisis in silico y de Jaccard. Por PCR se detectaron genes de fimbrias. Se realizaron ensayos biológicos con aislados de plantas y clínicos. Resultados: Los genes de colonización de plantas como celulasas, catalasas y hemaglutininas se encontraron principalmente en genomas de K. variicola. Las β-lactamasas cromosómicas son características de la especie y en algunos casos estaban mal clasificadas. K. variicola y K. pneumoniae producen hormonas vegetales. Conclusiones: Se encontró una distribución en mosaico de los genes de asociación con plantas y de virulencia en K. variicola y K. quasipneumoniae. Principalmente en K. variicola se encontraron algunos genes involucrados en la colonización de plantas. Se propone el término plantanosis para las infecciones humanas de origen vegetal.

Efeito Inibitório De Monoterpenos Frente A Klebsiella Pneumoniae Produtoras de ESBL / The Inhibitory Effect of Monoterpenes against ESBL-Producing Klebsiella pneumoniae

Introdução: Klebsiella pneumoniae é um bacilo Gram negativo membro da família Enterobacteriaceae, em que seus principais sítios de infecção se encontram no trato respiratório e urinário. Devido ao crescimento desenfreado da automedicação, vários microrganismos vem desenvolvendo mecanismos de resistência com maior frequência, desta forma tornando o tratamento cada vez difícil, sendo necessária a pesquisa de novas alternativas terapêuticas mais eficientes. Diversos produtos naturais têm sido estudados, a exemplo dos óleos essências e dos monoterpenos que vem apresentando ação bastante promissora frente aos microrganismos. Objetivo: Nessa perspectiva, este trabalho teve como objetivo avaliar a ação antibacteriana dos fitoconstituintes citral, citronelal e citronelol contra as cepas de K. pneumoniae produtora de betalactamase de amplo espectro (ESBL) e determinar a concentração inibitória mínima (CIM) destes monoterpenos. Materiais e Métodos: Foi realizada a técnica de microdiluição seriada a uma razão de dois, nas concentrações de 2048, 1024, 512, 256, 128, 64 a 32 µg/ mL , utilizando como meio de cultura o caldo Mueller Hinton, reservando a última coluna para o controle do crescimento microbiano, testando também a esterilidade do meio de cultura. Os experimentos foram realizados em triplicata e incubados na estufa a uma temperatura de 37 CÚ ± 2 CÚ, por um período de 24 horas, tendo como avaliação dos ensaios o método visual. Resultados: Através dos experimentos realizados, notouse que os fitoconstituintes citral, citronelal e citronelol não inibiram o crescimento das cepas de K. pneumonia nas condições e concentrações testadas. Conclusão: Os monoterpenos não apresentaram atividade antibacteriana contras cepas testadas. (AU)

Introduction: Klebsiella pneumoniae is a Gram-negative bacillus of the Enterobacteriaceae family which may infect primarily the respiratory and urinary tracts. Due to the uncontrolled growth of self-medication, various microorganisms have been developing resistance mechanisms with a greater frequency, thus making infections increasingly difficult to treat. Further research is then required to develop new, more effective treatment options. Several natural products have been studied, such as essential oils and monoterpenes, which have shown promising activity against selected microorganisms. Objective: This study aimed to evaluate the antibacterial activity of the phytochemicals citral, citronellal and citronellol against K. pneumoniae strains producing extended-spectrum beta-lactamases (ESBL), and to determine the minimum inhibitory concentration (MIC) of these monoterpenes. Material and Methods: A serial microdilution technique was performed to test the samples at concentrations of 2048, 1024, 512, 256, 128, 64 and 32 ìg/ mL. Mueller Hinton broth was employed as the culture medium, and the last column was used for the control of microbial growth and medium sterility. The experiments were carried out in triplicate and incubated at 37 CÚ ± 2 CÚ for 24 hours, followed by visual reading. Results: The phytochemicals citral, citronellal and citronellol did not inhibit the growth of K. pneumonia strains under the conditions and concentrations tested. Conclusion: The monoterpenes presented herein showed no antibacterial activity against the tested strains.(AU)

Displacers improve the selectivity of phosphopeptide enrichment by metal oxide affinity chromatography / Uso de desplazadores para mejorar la selectividad de los fosfopéptidos enriquecidos por cromatografía de afinidad con óxidos de metales

Abstract: Background: A key process in cell regulation is protein phosphorylation, which is catalyzed by protein kinases and phosphatases. However, phosphoproteomics studies are difficult because of the complexity of protein phosphorylation and the number of phosphorylation sites. Methods: We describe an efficient approach analyzing phosphopeptides in single, separated protein by two-dimensional gel electrophoresis. In this method, a titanium oxide (TiO2)-packed NuTip is used as a phosphopeptide trap, together with displacers as lactic acid in the loading buffer to increase the efficiency of the interaction between TiO2 and phosphorylated peptides. Results: The results were obtained from the comparison of mass spectra of proteolytic peptides of proteins with a matrix-assisted laser desorption-ionization-time of flight (MALDI-TOF) instrument. Conclusions: This method has been applied to identifying phosphoproteins involved in the symbiosis Rhizobium etli-Phaseolus vulgaris.

Resumen: Introducción: Un proceso clave en la regulación celular es la fosforilación de proteínas, que se lleva a cabo por cinasas y fosfatasas. Sin embargo, los estudios de fosfoproteómica son difíciles debido a la complejidad de la fosforilación proteica y el número de sitios de fosforilación. Métodos: En el presente trabajo se describe una eficiente estrategia metodológica para analizar fosfopéptidos de proteínas separadas mediante electroforesis bidimensional. En este método, una columna con microesferas de dióxido de titanio (TiO2/NuTip) se utilizó para atrapar los fosfopéptidos en la superficie del TiO2 previamente empacado en una punta. El uso de desplazadores en el buffer de carga, como el ácido láctico, mejoró significativamente la selectividad. Resultados: Los resultados se obtuvieron mediante la comparación de los espectros de masas de péptidos proteolíticos de proteínas analizados utilizando un instrumento de desorción/ionización láser asistida por matriz-tiempo de vuelo (MALDI-TOF). Conclusiones: Este método se ha aplicado para la identificación de fosfoproteínas involucradas en la simbiosis del Rhizobium etli con Phaseolus vulgaris.

Resistance of non-fermenting Gram-negative bacilli isolated from blood cultures from an emergency hospital / Resistência de bacilos Gram-negativos não fermentadores isolados de hemoculturas de um hospital de emergência

ABSTRACT Introduction: Non-fermenting Gram-negative bacilli (NFGNB) are a heterogeneous group of microorganisms that do not have the ability to ferment carbohydrates as a way to obtain energy. There are more than 120 species classified as pathogenic, among them, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, Stenotrophomonas maltophilia and Burkholderia cepacia. Infections caused by these microorganisms are mostly acquired in the hospital environment, since they are opportunistic pathogens and are among the most important bacteria of greater clinical and epidemiological relevance. Objective: This study evaluated the resistance profile of NFGNB isolated from blood cultures at an emergency hospital in the city of Caruaru, Agreste Pernambuco (PE), Brazil. Methods: The strains present in the blood cultures were isolated on culture media MacConkey and Triple Sugar Iron (TSI) agar. The samples were also submitted to the oxidase test and the polymyxin resistance test, in addition to the Gram staining, to better identify NFGNB bacterial genera. An antibiogram test was carried out to verify the resistance profile. Results: It was found that from 87 (100%) isolated and analyzed strains, 11 (13%) were classified as NFGNB. The genus Acinetobacter sp. was the most frequently found (55%). The Acinetobacter sp. strains were resistant to gentamicin, meropenem, imipenem, amikacin, ciprofloxacin, ceftazidime and ceftriaxone. Conclusion: Screening of resistant NFGNB isolated, as well as greater attention to hospital-acquired infection control practices and epidemiological surveillance systems, in addition to continued care with regard to the targeted use of antibiotics can contribute to successful this battle against infections by these microorganisms.

RESUMO Introdução: Os bacilos Gram-negativos não fermentadores (BGNNF) são um grupo heterogêneo de microrganismos que não possuem a capacidade de fermentar carboidratos como forma de obtenção de energia. Possuem mais de 120 espécies classificadas como patogênicas, destacando-se entre elas Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, Stenotrophomonas maltophilia e Burkholderia cepacia. As infecções causadas por esses microrganismos são, em sua maioria, adquiridas nos ambientes hospitalares, já que se tratam de patógenos oportunistas, estando entre as bactérias de maior relevância clínica e epidemiológica. Objetivo: Este trabalho avaliou o perfil de resistência dos BGNNF isolados de hemoculturas em um hospital de emergência na cidade de Caruaru, no Agreste Pernambuco (PE), Brasil. Métodos: As cepas presentes nas hemoculturas foram isoladas nos meios de cultura ágar MacConkey e ágar Triple Sugar Iron (TSI). As amostras também foram submetidas ao teste de oxidase e ao teste de resistência a polimixina, além da coloração de Gram, para melhor identificação dos gêneros bacterianos de BGNNF. Foi realizado o antibiograma para verificação do perfil de resistência. Resultados: Verificou-se que das 87 (100%) cepas isoladas e analisadas, 11 (13%) foram classificadas como BGNNF. O gênero Acinetobacter sp. foi o mais frequente (55%). As cepas de Acinetobacter sp. apresentaram-se resistentes a gentamicina, meropenem, imipenem, amicacina, ciprofloxacina, ceftazidima e ceftriaxona. Conclusão: O rastreamento de isolados de BGNNF resistentes, bem como uma maior atenção às práticas de controle de infecção hospitalar e sistemas de vigilância epidemiológica, além do cuidado contínuo em relação ao uso direcionado de antibióticos podem contribuir no combate a infecções por esses microrganismos.

Synthesis, characterization and in vitro antimicrobial screening studies of some pyridyl-coumarin compounds / Síntesis, caracterización y evaluación antimicrobiana in vitro de algunos derivados de piridil-coumarina

SUMMARY In vitro antimicrobial screening of some pyridyl-coumarin compounds were done against some bacterial and fungal strains in DMF and DMSO. These pyridyl-coumarin compounds were synthesized in the laboratory and their structure was confirmed by different spectroscopic techniques such as IR, 1H NMR, 13C NMR and mass. Some of these compounds exhibited excellent antibacterial activity in both the solvents.

RESUMEN La actividad antimicrobiana in vitro de algunos compuestos derivados de piridil-coumarina se evaluó frente a algunas cepas bacterianas y fúngicas en DMF y DMSO. Las piridil-cumarinas se sintetizaron en el laboratorio y sus estructuras se confirmaron por diferentes técnicas espectroscópicas, tales como IR, 1H NMR, 13C NMR y masas. Algunos de los compuestos que se obtuvieron presentaron buena actividad antibacteriana en ambos solventes.

Displacers improve the selectivity of phosphopeptide enrichment by metal oxide affinity chromatography.

BACKGROUND: A key process in cell regulation is protein phosphorylation, which is catalyzed by protein kinases and phosphatases. However, phosphoproteomics studies are difficult because of the complexity of protein phosphorylation and the number of phosphorylation sites. METHODS: We describe an efficient approach analyzing phosphopeptides in single, separated protein by two-dimensional gel electrophoresis. In this method, a titanium oxide (TiO2)-packed NuTip is used as a phosphopeptide trap, together with displacers as lactic acid in the loading buffer to increase the efficiency of the interaction between TiO2 and phosphorylated peptides. RESULTS: The results were obtained from the comparison of mass spectra of proteolytic peptides of proteins with a matrix-assisted laser desorption-ionization-time of flight (MALDI-TOF) instrument. CONCLUSIONS: This method has been applied to identifying phosphoproteins involved in the symbiosis Rhizobium etli-Phaseolus vulgaris.